著作：
研发外包、知识产权保护与我国企业的自主创新——基于不完全合约视角的研究，中国财政经济出版社，2017.3
论文：
1.马卫红，合约实施效率会影响企业开放式创新吗——来自中国的经验证据，山西财经大学学报（CSSCI），2015，（1）：81-92；
2.马卫红，外资研发、制度环境与高技术产业的自主创新，国际商务（CSSCI），2015，（4）：143-152；
3.马卫红，外资研发、制度环境与我国工业企业创新——基于微观企业数据的实证研究，兰州商学院学报，2015，（1）：26-35.
4.马卫红，黄繁华，生产者服务业与制造业的互动发展与行业差异——基于长三角地区的实证研究，上海经济研究（CSSCI），2012，（5）：75-84.
5.马卫红，黄繁华，知识密集型生产者服务业与高技术产业的互动发展——基于上海的实证分析，经济体制改革（CSSCI），2012，（3）:100-104.
6.马卫红，生产者服务业发展的影响因素研究——以长三角地区为例的实证分析，经济与管理，2012，（2）:63-67+71.
7.马卫红，生产者服务业与制造业的互动与融合:研究进展及展望——兼议对长三角地区的分析，兰州商学院学报，2011，（5）:84-91.
8.马卫红，黄繁华，长三角、京津冀、珠三角制造业竞争力比较——基于偏离—份额分析法，山西财经大学学报（CSSCI），2010，（12）:1-11.
